1、规定双方的权利和义务。尤其要说明在分居期间，夫妻双方不再有义务与其丈夫或妻子同居。2、协议中要说明子女有谁抚养，抚养费如何承担以及探望权如何行使？例如约定了分居期间孩子由哪些抚养，另一方需要承当多少抚养费。3、可以对分居期间的财产进行约定，如无约定或无法达成协议，则仍视为夫妻共同财产。双方若同意，可以在协议中规定分居期间双方不再互相享有家事代理权(但无法对抗善意第三人)，如果一方违反则要赔偿另一方的损失。双方若同意，可以约定分居期间因为一方而产生的债务一律视为个人债务(同样无法对抗善意第三人)，一方如果违反要赔偿另一方的损失。4、分居的期限，应以三个月至两年为限，期限届满，如一方当事人依然认为感情无法复合而要求离婚的，可协议离婚或持该协议向起诉离婚。5、分居的终止。协议分居可基于当事人双方的协议而终止，但应当制作终止分居的书面协议，或办理终止分居的公证。6、其他的约定的条款。
